Nicht so schnell mit den jungen Gäulen... oder so.
Das ist schon richtig so: Die hohe Seite des Steg gehört unter die E-Saite, die niedrige unter die G-Saite. Was daran liegt, dass die Auslenkung der E-Saite beim Schwingen größer ist als die der G-Saite.
Ich denke der Bass geht deshalb wieder, weil du einfach den Steg nochmal raus- und reingelegt hast und er jetzt wieder besser auf dem Pickup liegt.
Also eigentlich hast du den Steg falsch herum eingebaut. Wenn der Bass jetzt aber gut funktioniert, der Saitenabstand vom Griffbrett angenehm ist und die E-Saite nicht schnarrt (auch nicht in den hohen Lagen),dann ist ja gut. Du kannst dann vielleicht den Steg unter den anderen Saiten noch etwas flacher feilen, um die Saitenlage weiter zu verbessern.