Kaputt geht nix.
Dass dein Gitarrist sagt, dass einige davon in den Loop kommen liegt daran, dass die ihre Amps für gewöhnlich verzerrt spielen. Einige Effekte wie z.B. Chorus klingen vor bzw hinter einer Zerre teils drastisch anders. Anders, nicht besser. Unser Gitarrist spielt generell alles vorne rein und klingt geil.
Da Bassamps meist nicht zerren erübrigt sich diese "Problematik" und man kann einfach alles vorn reinjagen. Aber auch hier kann man mit der Reihenfolge experimentieren. Es gibt da kein falsch.
Die Loops der Bassamps haben meist auch Studiopegel (im Zweifel ins Handbuch schauen) um Studioeffekte wie z.B. Rackkompressoren einzuschleifen, die auf Instrumentenpegel meist nicht richtig arbeiten bzw Potential verschenken. Es ist gut möglich, dass man Pedale, die man in den Loop packt mit dem Line Pegel komplett überfährt.
Manche Effektwege sind parallel, sodass man das Ampsignal mit dem Effektsignal beliebig mischen kann. Sowas kann durchaus noch interessant sein aber für die Kohle, die man in die beiden zusätzlichen Kabel stecken muss kann man sich schon fast ein Pedal kaufen, dass ebenfalls zwei Signale mischen kann und handlicher ist
Kurz: wenn dein Amp nicht zerrt ergibt sich daraus kein Mehrwert.