Natürlich spielt das eine Rolle. Wenn die Flatwound aufgrund der Wicklung mehr Masse hat, muss man sie stärker spannen um die gleiche Tonhöhe zu bekommen.
Deswegen sind e und h Saite bei einer Westerngitarre ja auch blank. Würde man eine umwickelte Saite mit dem gleichen Kerndurchmesser nehmen...